Новосибирский областной геронтологический центр создан в октябре 1994 года, в соответствии с постановлением главы администрации Новосибирской области от 16.10.1994 № 390 «Об открытии геронтологического центра».
В 2010 году, согласно Постановлению Правительства Новосибирской области от 29.11.2010 № 222-п, Учреждение переименовано в Государственное автономное учреждение социального обслуживания Новосибирской области «Новосибирский областной геронтологический центр». Учредителем и собственником имущества Учреждения является Новосибирская область.
Полномочия учредителя Учреждения осуществляют Правительство Новосибирской области, департамент имущества и земельных отношений Новосибирской области и министерство труда и социального развития Новосибирской области.
Органами управления Учреждения являются наблюдательный совет Учреждения, руководитель Учреждения, а также общее собрание (конференция) работников автономного учреждения.